Manipulation de données bibliométriques via {managHAL}

Martin AMIENS

MIA - Paris-Saclay

2024-04-07

Martin AMIENS

  • Stagiaire au sein de l’unité MIA - Paris-Saclay.
  • Etudiant en première année du master Bio-Informatique et Bio-Statistiques à Paris-Saclay.
  • Tuteurs : Julie AUBERT, Pierre BARBILLON

Plan

  • Contexte du stage
  • Objectifs du stage
  • introduction aux Réseaux
  • Accessibilité et généricité de {managHAL}
  • Ajout de fonctionnalités à {managHAL}
  • Discussion, Perspectives et avenir du package

Contexte

  • DRIT : Direction des Recherches et de l’Innovation Technologique
  • Sciences Ouvertes : “est la diffusion sans entrave des publications et des données de la recherche.” (Webmestre,2021)
  • HAL : Hyper Articles en Ligne

Crédit : CCSDForge
  • {ManagHAL} : Package R d’extraction de données bibliométriques de HAL

Objectifs du stage

  • Accessibilité et généricité de {managHAL}
  • Ajout de fonctionnalités à {managHAL}

Accessibilité et généricité de {managHAL}

Accessibilité et généricité de {managHAL}

# A tibble: 3 × 13
  civilite nom       prenom statut rattachement  debut_contrat fin_contrat
  <chr>    <chr>     <chr>  <chr>  <chr>         <chr>         <chr>      
1 M.       ADJAKOSSA Éric   CEC    AgroParisTech ""            ""         
2 Mme      AUBERT    Julie  IR     INRAE         ""            ""         
3 M.       BARBILLON Pierre PR     AgroParisTech ""            ""         
# ℹ 6 more variables: financement <chr>, equipe <chr>, unite <chr>,
#   orcid <chr>, idhal <dbl>, adresse_mail <chr>
# A tibble: 1 × 11
    docid halId_s      version_i docType_s citationFull_s          citationRef_s
    <int> <chr>            <int> <chr>     <chr>                   <chr>        
1 4440523 hal-04440523         1 COMM      Isabelle Lebert, Maxim… Colloque fin…
# ℹ 5 more variables: publicationDate_tdate <chr>,
#   authFullNamePersonIDIDHal_fs <chr>, structAcronym_s <chr>,
#   structId_i <chr>, structHasAlphaAuthIdHalPersonid_fs <chr>
# A tibble: 4 × 8
    docid halId_s      version_i docType_s citationFull_s          citationRef_s
    <int> <chr>            <int> <chr>     <chr>                   <chr>        
1 3781287 hal-03781287         1 COMM      Wenfan Cao, Maxime Lec… FOODMICRO 20…
2 3694338 hal-03694338         1 COMM      Wenfan Cao, Maxime Lec… 23ème éditio…
3 3811607 hal-03811607         1 COUV      Julie J. Aubert, Pierr… Statistical …
4 4019111 hal-03604836         1 ART       Sana Romdhane, Aymé Sp… The Internat…
# ℹ 2 more variables: publicationDate_tdate <chr>,
#   authFullNamePersonIDIDHal_fs <chr>

Introduction aux Réseaux

Un réseau est composé de :

  • noeuds (entités)

  • arêtes (interactions entre ces entités)

A : Exemple de Réseau trophique (réseau d’interactions des espèces chiliennes), Crédit : (Kéfi et al. 2016)

B : RAD51 et son réseau d’interactions de sa famille de gènes, Crédits : (Li et al., 2021)

Ajout de fonctionnalités à {managHAL}

construction d’un réseau de co-auteur

Ajout de fonctionnalité à {managHAL}

Modélisation en blocs stochastiques

ajout de fonctionnalité à {managHAL}

<div class="iframe-wrapper">
    <iframe src="img/Partial_Network_Co-authors_Example_managHAL_sbm.html"></iframe>
</div>
<div class="iframe-wrapper">
    <iframe src="img/Partial_Network_Co-authors_Example_managHAL.html"></iframe>
</div>

Discussion, Perspectives et avenir du package

parler des limitations vu par rapport aux quatres graphes précédents, comment je peux les régler (analyses sur composantes connexe), parler du développement du package et de ce qui sera disponible, la finalité du stage.

Merci de m’avoir écouté

Questions ?

Méthodes informatiques

ne faire que si j’ai le temps, les mettres dans les diapos de questions possible ? parler version Rstudio, package utilisés, explication de …

quelles sont les questions qui peuvent venir au cours de ma présentation,

quelles sont les choses dont je n’ai pas parlé au cours de ma présentation,

sources

https://www.ouvrirlascience.fr/plan-national-pour-la-science-ouverte/

<>

<>